Organisasi Badan Kepegawaian Daerah terdiri dari:

A. Kepala Badan

B. Bagian Tata Usaha;
     1. Sub Bagian Umum dan Kepegawaian
     2. Sub Bagian Keuangan

C. Bidang Mutasi dan Pengadaan Pegawai
     1. Sub Bidang Mutasi Kepegawaian
     2. Sub Bidang Formasi dan Pengadaan Pegawai

D. Bidang Pengembangan dan Data Pegawai
     1. Sub Bidang Diklat dan Pengembangan Pegawai
     2. Sub Bidang Data Pegawai

E. Bidang Peraturan Perundang-undangan dan Kesejahteraan Pegawai
     1. Sub Bidang Disiplin dan Peraturan Kepegawaian
     2. Sub Bidang Kesejahteraan Pegawai

F. Kelompok Jabatan Fungsional